Situé dans la zone subtropicale, l'archipel a généralement un climat humide, affecté par le courant du Golfe et les vents du nord-est. Il n'y a que deux saisons bien distinctes: la saison sèche, de novembre à avril; et la saison humide, de mai à octobre. Les précipitations annuelles sont de 1 375 mm en moyenne et l'humidité relative de l'air atteint ses valeurs les plus hautes tôt le matin et l'après-midi. La moyenne de températures varie entre les 26 et 28ºC, sauf dans les plaines qui possèdent une moyenne plus haute,ainsi que les hauteurs et les montagnes qui possèdent des moyennes inférieures aux 26ºC (dans la Sierra Maestra elle est inférieure aux 20ºC).

L'été, il fait très chaud. L'hiver est court et agréable. Le printemps est une saison presque permanente dans tout l'archipel. La région orientale est soumise à un climat plus chaud que celui de la région occidentale. Les différences de températures entre le jour et la nuit varient peu dans les régions côtières,mais c´est différent à l'intérieur du pays. Pendant l'hiver, des masses d'air froid provenant du nord et tendant à être des fronts de courte durée, influent sur l'île. De juin à novembre, c'est l'époque des ouragans; ces systèmes tropicaux sont accompagnés de pluies torrentielles et de pénétrations de la mer. A l'exception de quelques jours hivernaux, le climat de l'île est merveilleux.