Aujourd'hui Cuba possède une flore composée de 7000 espèces de plantes environ, dont un peu plus de la moitié sont endémiques. Plus de 100 espèces font partie de sa flore,et la quasi totalité sont exclusives dans l'archipel. Parmi tant de beautés de plantes et de fleures, ce sont les Orchidées qui occupent la place d'honneur. Ses plus de 300 espèces, caractérisées par ses couleurs voyantes et ses formes uniques,offrent l'un des patrimoines floraux les plus significatifs de l'île. La Caña de ámbar ou Mariposa, une petite orchidée aux pétales blancs, est la fleur nationale. Le palmier royal (l'arbre national), le palmier nain (considéré comme un fossile vivant) et les cactus, sont trois exemples typiques qu'on peut trouver dans la campagne cubaine.

En se qui concerne quelques groupes d'animaux, comme les mollusques et les amphibiens, l'endémisme peut atteindre des valeurs supérieures a 90% : pour les reptiles c'est 80%. Quelques espèces sont très fameuses au niveau international,comme par exemple: les polimitas,qui sont des escargots exclusifs des provinces orientales et qui ont une telle diversité dans leur couleur qu'on n´en trouvera jamais deux égales. Le tocororo, de la famille du quetzal et qui reproduit dans son plumage les couleurs du drapeau national, est aussi l'oiseau national. Les mammifères terrestres sont représentés par: les agoutis, les chauve-souris et l'almiquí. Le zunzuncito ou l'oiseau mouche, le scorpion Microtytus, la petite grenouille cubaine et le sijucito, se trouvent entre les espèces les plus petites du monde. Quelques espèces en danger d'extinction sont: l'agouti conga, l'almiquí, le charpentière royal, le crocodile cubain et le manatí entre autres. Les récifs coraliens de l'île sont considérés comme les plus conservés de la Caraïbe.

Cette richesse se trouve dispersée dans des échosystèmes différents, dont 75% sont des plaines, 18% des montagnes et 4% des marécages. La haute biodiversité peut aussi être appréciée dans les différents paysages se combinant entre les semideserts et les hauteurs, jusqu'aux forêts humides et tropicales. Il existe un total de 8 665.8 km2 de zones protégées.A Cuba, on ne rencontre ni plantes ni animaux dangereux pour l'homme.